يهدف ديوان المحاسبة إلى أعلى مستوى من التدقيق و من أجل تنفيذ ذلك باتقان فانه يقوم بـ:

1. التحقق من مشروعية وسلامة إدارة الأموال العامة ومن تنفيذ المشروعات الإنمائية

2. تحديد المركز المالي الحقيقي لهيئات القطاع الاقتصادي وتقويم مدى سلامة إدارتها لأموالها

3. التحقق من سلامة عمليات الجرد السنوي ودراسة الأسباب التي تؤدي إلى تكديس المواد المخزونة أو تلفها واقتراح الوسائل المناسبة للمحافظة على تلك المواد وصيانتها والقواعد اللازمة لوضع خطط سليمة لتموين المستودعات والمخازن.

4. الكشف عن حوادث الاختلاس والإهمال والمخالفات المالية والتحقيق فيها وبحث بواعثها ودراسة نواحي القصور في التشريع ونظام الرقابة الداخلية التي أدت إلى وقوعها واقتراح وسائل علاجها